藻場は、海藻や海草がつくる草原状、森林状の群落で、様々な魚介類の産卵場や生育場となっており、二酸化炭素や陸域からの負荷（窒素やリン）を吸収する大切な役割も担っています。これまで、多くの藻場は、そこを生業（なりわい）の場とする漁師の皆さんによって手入れがされてきましたが、近年、環境の変化などによって藻場の面積が大きく減少しています。

水産多面的機能発揮対策事業では、このような藻場の再生や保全に取り組む漁師や市民の皆さんのグループを支援しています。